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磁共振成像的圖畫與CT圖畫十分相似，二者都是“數字圖畫”，并以不同灰度閃現不同結構的解剖和病理的斷面圖畫。與CT相同，MRI監護儀也幾乎適用于全身各系統的不同疾病，例如腫瘤、炎癥、傷口、退行性病變，以及各種先天性疾病等的檢查。
磁共振成像無骨性偽影，可隨意作直接的多方向（橫斷、冠狀、矢狀或任何角度）切層，對顱腦、脊柱和脊髓等的解剖和病變的閃現，尤優于CT，磁共振成象借其“流空效應”，可不用血管造影劑，閃現血管結構，故在“無損傷”地閃現血管（細小血管在外），以及對腫塊、淋巴結和血管結構之間的相互辨別方面，有獨到之處。
磁共振成像有高于CT數倍的軟組織分辯才能，它能靈敏地檢出組織成分中水含量的改動，故?？杀菴T更有用和前期地發現病變。通過磁共振血流成像技術的研討獲得的進展，使在活體上測定血流量和血流門控的使用，使磁共振成像能清楚地、全面地閃現心臟、心肌、心包以及心內的其他纖細結構，為無損地檢查和確診各種獲得性與先天性心臟疾患（包括冠心病等），以及心臟功用的檢查，提供了可靠的方法。跟著各種不同的快速掃描序列和三維取樣掃描技術的研討和成功地應用于臨床，磁共振血管造影和電影拍照新技術已步入臨床，且日臻完善。又完成了磁共振成像和部分頻譜學的結合（即MRI與MRS的結合），以及除氫質子以外的其他原子核如氟、鈉、磷等的磁共振成像，這些效果將能更有用地進步磁共振成像確診的特異性，也開闊了它的臨床用處。
磁共振成像術的主要缺少，在于它掃描所需的時間較長，因而對一些不合作的患者的檢查常感困難，對運動性器官，例如胃腸道因缺少適宜的比照劑，常常閃現不清楚；關于肺部，因為呼吸運動以及肺泡內氫質子密度很低一級原因，成像作用也不滿意。磁共振成像對鈣化灶和骨骼病灶的閃現，也不如CT確和靈敏。磁共振成像術的空間分辯室，也有待進一步進步。
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